Кафедра физиологической химии (так раньше именовалась биохимия) Женского медицинского института  была основана в 1898 году профессором Сергеем Сергеевичем Салазкиным. К этому времени профессор С. С. Салазкин уже сложился как крупный ученый-биохимик и квалифицированный педагог и поэтому организовал учебный процесс  на самом высоком уровне. Профессор С. С. Салазкин известен в истории не только как ученый и педагог, но и как крупный общественный деятель. Он участвовал в работе народовольческих кружков, в революции 1905 года, был членом Временного правительства. В результате этой деятельности ему дважды пришлось быть узником Петропавловской крепости. В период работы в ЖМИ Сергей Сергеевич стал играть ведущую роль в Совете института, и в 1905 году, когда должность директора стала выборной, первым занял ее. Однако, в 1911 году за сочувствие к студенческому движению проф. С. С. Салазкин был снят с должностей директора и заведующего кафедрой и выслан из столицы.

В период вынужденной отставки проф. С. С. Салазкина кафедру возглавлял профессор Борис Иванович Словцов. Воспитанник Военно-медицинской академии, проф. Б. И. Словцов к моменту перехода из Саратовского университета в ЖМИ уже имел большой опыт преподавательской и исследовательской работы. Его научные интересы были связаны с биохимией мозга, вопросами “обмена и питания". Широко известны его “Пищевые раскладки", изданные в годы Первой мировой войны. Много сил и времени Б. И. Словцов отдавал общественной работе и популяризации научных знаний. Он читал лекции в Народном доме Паниной, стоял у истоков создания Общества российских физиологов, являлся ответственным редактором “Русского физиологического журнала". В 1925 году на кафедру биохимии уже 1 ЛМИ вернулся профессор С. С. Салазкин, который проработал в этой должности до 1931 года. С момента основания кафедры и до этого периода научная работа сотрудников проводилась на базе отдела биологической химии Института экспериментальной медицины. И С. С. Салазкин, и Б. И. Словцов в разные годы возглавляли этот отдел и даже весь Институт экспериментальной медицины (Б. И. Словцов – 1920-1922 гг.; С. С. Салазкин – 1927-1932 г г.).

После 1925 года появилась возможность технического оснащения кафедры, оборудования учебных комнат и научных помещений. Сотрудники уже могли выполнять экспериментальную работу на кафедре и привлекать к научной работе студентов. Именно 1925 год является годом основания студенческого научного общества (СНО) при кафедре биохимии. В 1931 году С. С. Салазкин по болезни оставляет кафедру, на которую избирается профессором Юлия Марковна Гефтер. За плечами Ю. М. Гефтер было блестящее образование и опыт научной и педагогической работы в Московском университете. Начало ее деятельности в нашем ВУЗе пришлось на благоприятные годы. В этот период возросла государственная поддержка высшего образования, улучшилось материальное и финансовое обеспечение.  Профессор Ю. М. Гефтер привнесла много нового и в учебный процесс, и в научную работу коллектива. Совершенно особое место в научном наследии профессора Ю. М. Гефтер занимают работы, выполненные в период блокады Ленинграда. Она сумела не только обеспечить продолжение учебного процесса, но и вместе с коллегами (Е. Л. Глинка-Черноруцкая, Н. Н. Кац, О. Н. Абакумова, А. В. Захарова) вести исследования по актуальной тогда проблеме алиментарной дистрофии. В годы блокады Ю. М. Гефтер не только руководила кафедрой, но и была заместителем директора института по научной работе. Профессор Ю. М. Гефтер оставила заведование кафедрой в 1964 году, но не прерывала активной деятельности, работая профессором-консультантом вплоть до своей кончины. Перед смертью в 1969 году Юлия Марковна передала на текущий счет профкома института значительную сумму личных сбережений с целью премирования лучших студенческих работ в области биохимии, фармакологии, нормальной и патологической физиологию. С тех пор и до 1985 года лучшие студенческие работы отмечались этой премией.

В 1964 году заведующим кафедрой биохимии был избран профессор Виктор Иосифович Розенгарт. Крупный ученый в области энзимологии В. И. Розенгарт привнес много нового в работу коллектива. Он существенно пересмотрел лекционный курс, в котором реализовал свой опыт исследователя. Научная работа проводилась в содружестве с Институтом элементоорганических соединений (г. Москва) и Институтом биоорганической химии (г. Ташкент) и была посвящена изучению строения и свойств ацетилхолинэстеразы. Профессор В. И. Розенгарт заведовал кафедрой до 1972 года, когда по состоянию здоровья был вынужден оставить очень напряженную работу в ВУЗе и перейти на работу в Институт эволюционной физиологии и биохимии им. акад. И. М. Сеченова.

С 1972 года кафедру биохимии возглавлял профессор Игорь Григорьевич Щербак. В ряду заведующих нашей кафедрой он занимает особое место. В то время как все предыдущие руководители приходили на кафедру уже сложившимися учеными, Игорь Григорьевич “вырос" на кафедре, впитал лучшие ее традиции. Игорь Григорьевич начал свой путь в науку с работы в кружке СНО. Будучи студентом, он опубликовал 11 печатных работ, ежегодно выступал на студенческих конференциях. В 1962 году Игорь Григорьевич защитил кандидатскую диссертацию, а в 1974 – докторскую.  Вступив в должность заведующего кафедрой, И. Г. Щербак много внимания уделял учебному процессу. Большое значение Игорь Григорьевич придает унификации преподавания, единству подхода к оценке знаний студентов. В 70-е годы изменилась и работа кружка СНО. Если раньше СНОвцы решали какие-либо специально поставленные перед ними задачи коллективно, то с этого периода и по настоящее время они работают под индивидуальным руководством ассистента или доцента, включаясь в научную работу кафедры. В результате СНОвцы смогли стать соавторами статей, опубликованных в ведущих журналах и солидных сборниках. Профессор Игорь Григорьевич Щербак является ведущим ученым-биохимиком, автором теории порогового принципа регуляции каскадных протеолитических систем. Он организовал и возглавил лабораторию НИЦ «Биохимия протеолитических систем». Является руководителем 10 кандидатских и двух докторских диссертационных работ. Профессор И. Г. Щербак проявил новаторство в преподавании биохимии. Первым внедрил в учебный процесс изучение вопросов саморегуляции метаболических путей. Является автором популярного учебника: «Биологическая химия», Изд-во СПбГМУ, 2005.

С 2000 года по 2016 кафедрой руководила профессор Людвига Вячеславовна Галебская. Профессор Л. В. Галебская продолжает традиции кафедры: основное направление исследований – изучение протеолитических систем крови. Кроме того, ею проводятся работа в области фотобиохимии, изучения механизмов цитолиза и педагогики высшей школы.

В 2016-2017 гг кафедра находилась под руководством профессора Власова Тимура Дмитриевича. В настоящее время кафедрой руководит д.м.н. Васина Любовь Васильевна